985、211的學生：大學審查部門國家留學基金委、駐華使館的審查國家留學基金委、駐華使館的面試。
非211大學及社會人：各省市教育廳的審查國家留學基金委、駐華使館的審查國家留學基金委、駐華使館的面試。
985大學和211大學基本都和國家留學基金委簽訂了合作協議，因此每年都有去各個國家的獎學金名額分配到各大學。大學設有專門的審查部門。第一輪刷選淘汰一部分，通過后送到國家留學基金委、駐華使館進行第二輪審查。
非211大學和社會人要交到當地省教育廳審查，第一輪刷選淘汰一部分。通過后送到國家留學基金委、駐華使館進行第二輪審查。
如果第一輪沒有接到通過的信息則是被刷下來了。第二輪審查時候，由日本駐華大使館教育參贊和留學基金委共同審查985和211大學的候選人材料和由教育廳選送的候選人材料，在所有候選人中刷選出190名進行最后的面試。淘汰其他的。如果第二輪沒接到面試通知說明淘汰了。
面試由中日雙方組成，主要是日方使館為主，一般是5-6人的面試官。圍繞研究計劃書和留學日本為主線進行面試，平均一個人要30-40分鐘。之后最終確定110名。淘汰80名。
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