奧塔哥大學有全新西蘭第一所醫(yī)學院，并且是南島的醫(yī)學研究中心，由于是第一個將試管嬰兒付諸實際的醫(yī)學中心，因此在世界上享有盛名。奧塔哥大學也有全新西蘭唯一的牙醫(yī)學校，其國際排名更是在前十名內，且為大洋洲第一名，此外，奧塔哥大學也是南島唯一設有藥學、理療、醫(yī)學實驗等科系的學校。這所醫(yī)學院至今依舊聞名，其入學的要求與一般大學相同，第一年所有學生都要學習必修科目，然后依成績決定往后的專業(yè)科系。
學校其他非醫(yī)學科系，如生理、解剖等也是世界有名的，新興科系如生化、基因工程，或者是基礎科學如物理、化學、數學等也都有開課，另外還有商學和法學等科目。尤其是商學院，和奧克蘭大學的商學院一樣聞名于新西蘭，每年都有百多位國際留學生，來此地取得奧塔哥大學MBA的學位。
大學預科
奧塔哥大學大學預科由澳大利亞名校新南威爾士大學與奧塔哥大學于1997年創(chuàng)立，授課地點在奧塔哥大學(達尼丁)和奧克蘭商學院(奧克蘭)。因此也可以說，奧塔哥大學大學預科就是新南威爾士大學在新西蘭的大學預科。大學預科為海外學生提供了進入奧塔哥大學及新南威爾士大學的機會，也為未來的大學教育打下堅實的基礎。這個課程為所有新西蘭和澳大利亞大學和部分美國和英國大學認可并被認可等同于大學人學資格。
語言中心
新西蘭奧塔哥大學語言中心為攻讀大學課程或者大學預科課程的學生提供強化英語和學習技巧的預科課程。語言中心是托福和雅思考試注冊中心，課程為考試提供專門準備課程。