一般均具次生構(gòu)造，與地上莖相似。外表常有木栓層，少數(shù)有表皮。如木栓形成層發(fā)生在皮層外方，則初生皮層仍然存在，如黃連等；有些根莖僅有栓內(nèi)層細(xì)胞構(gòu)成次生皮層。皮層中有根跡維管束或葉跡維管束斜向通過，內(nèi)皮層多不明顯。中柱外方部位有的具厚壁組織，如纖維和石細(xì)胞群，常排成不連續(xù)的環(huán)。草本植物的根莖維管束大多為無(wú)限外韌型，少數(shù)為雙韌型，多呈環(huán)狀排列，束間被髓射線分隔。中央有髓部。雙子葉植物根莖除上述正常構(gòu)造外，還可形成異常構(gòu)造，常見的有下列二種類型：
① 髓部有異常維管束，其韌皮部和木質(zhì)部的位置常與外部正常維管束倒置，即韌皮部在內(nèi)側(cè)，木質(zhì)部在外方，如大黃等。
② 具內(nèi)生韌皮部（Internal Phloem），就是位于木質(zhì)部里端的韌皮部。有的與木質(zhì)部里端密切接觸，構(gòu)成正常的雙考試大，網(wǎng)站收集韌型維管束；有的在髓部的周圍形成各個(gè)分離的韌皮部束。 內(nèi)生韌皮部存在的位置和形成均與內(nèi)函韌皮部不同，如茄科、葫蘆科植物等。
① 髓部有異常維管束，其韌皮部和木質(zhì)部的位置常與外部正常維管束倒置，即韌皮部在內(nèi)側(cè)，木質(zhì)部在外方，如大黃等。
② 具內(nèi)生韌皮部（Internal Phloem），就是位于木質(zhì)部里端的韌皮部。有的與木質(zhì)部里端密切接觸，構(gòu)成正常的雙考試大，網(wǎng)站收集韌型維管束；有的在髓部的周圍形成各個(gè)分離的韌皮部束。 內(nèi)生韌皮部存在的位置和形成均與內(nèi)函韌皮部不同，如茄科、葫蘆科植物等。