出口貨物只有在適用既免稅又退稅的政策時，才會涉及如何計算退稅的問題。由于各類出口企業(yè)對出口貨物的會計核算辦法不同，有對出口貨物單獨核算的，有對出口和內銷的貨物統(tǒng)一核算成本的。為了與出口企業(yè)的會計核算辦法相一致，原《出口貨物退（免)稅管理辦法）規(guī)定了兩種退稅計算辦法，一種是：出口企業(yè)兼營內銷和出口貨物，且其出口貨物不能單獨設賬核算的，應先對出口的貨物免征出口環(huán)節(jié)增值稅，然后對內銷貨物計算銷項稅額并扣除當期進項稅額后，對未抵扣完的進項稅額再用公式計算出口貨物的應退稅額。這種計算辦法，簡稱為“免、抵、退” 辦法，在1994年辦理退稅時，主要適用于對內外銷貨物實行統(tǒng)一核算成本的生產(chǎn)企業(yè)。1997年2月國務院決定凡是具有進出口經(jīng)營權的生產(chǎn)企業(yè)（包括內資企業(yè)、1994年1月1日以后批準設立的外商投資企業(yè)及生產(chǎn)型集團公司）自營出口或者委托外貿(mào)企業(yè)代理出口的貨物，除了另有規(guī)定者外，自1997年1月1日日起，一律實行“免、抵、退”辦法。1993年12月31日前已批準設立的外商投資企業(yè)出口貨物，自2001年1月1日后也按此辦法執(zhí)行。免稅，是指對上述貨物免征本企業(yè)生產(chǎn)銷售環(huán)節(jié)的增值稅；抵稅，是指上述貨物應當免征或者退還的所耗用的原材料、零部件等已納增值稅稅款，抵頂內銷貨物應納的增值稅稅款；退稅，是指上述貨物占本企業(yè)當期全部貨物銷售額50％以上的，在一個季度內，由于應當?shù)猪數(shù)脑鲋刀惗愵~大于應納稅額而未抵頂完時，經(jīng)過主管稅務機關批準，對未抵頂完的稅額予以退稅。
另一種計算辦法是：出口企業(yè)將出口貨物單獨設立庫存賬和銷售賬記載的，就依據(jù)購進出口貨物增值稅專用發(fā)票所列明的進項金額和退稅率計算應退稅額。由于運用這種辦法是對購進的出口貨物先繳稅，然后再納入國家出口退稅計劃審批退稅，因此，簡稱為“先征后退”辦法，主要適用于未按第一種“免、抵、退”辦法退稅的其他生產(chǎn)企業(yè)和外貿(mào)企業(yè)。
1995年，國務院調低退稅率后，財政部、國家稅務總局頒發(fā)的《出口貨物退（免）稅若干問題規(guī)定》對上述退稅辦法作了一定的修改。經(jīng)修改后從1995年7月1日起執(zhí)行的退稅辦法如下：
1．對確定為按“免、抵、退”辦法辦理出口退稅的有進出口經(jīng)營權的生產(chǎn)企業(yè)和1994年1月1日以后批準設立的外商投資企業(yè)，在1995年7月1日以后報關離境直接出口或委托代理出口的自產(chǎn)貨物，其辦理出口退（免）稅的程序是：
（1）免征出口環(huán)節(jié)增值稅；
（2）按該貨物所適用的增值稅稅率與其所適用的退稅率之差乘以出口貨物的離岸價格折合人民幣的金額，計算出口貨物不予抵扣或退稅的稅額，從當期（是指一個季度內，下同）全部進項稅額中剔除，計入產(chǎn)品成本；
（3）用剔除后的進項稅額余額，抵扣內銷貨物的銷項稅額，計算當期應納稅額；
（4）如果當期應納稅額為負數(shù)，且該企業(yè)出口貨物占當期全部貨物銷售額50％以上，則對當期未抵扣完的進項稅額按公式計算應退稅額：如果該企業(yè)出口貨物占當期全部貨物銷售額50％以下，則對當期未抵扣完的進項稅額結轉下期繼續(xù)抵扣，不予辦理退稅。
上述(2)(3)(4)項抵、退稅計算具體步驟及公式是：
當期不予 當期出 外匯 增值稅出口
抵扣或退 = 口貨物 * 人民幣 * （ 條例規(guī) - 貨 物）
稅的稅額 離岸價 牌價 定的稅率 退稅率
當期 當期內銷 當期全 當期不予 上期末抵
應納= 貨物的銷- （ 部進項 - 抵扣或退 ） - 扣完的進
稅額 項 稅 額 稅 額 稅的稅額 項 稅 額
若當期應納稅額為負數(shù)，也就是說，當期還有未抵扣完的進項稅額，且該企業(yè)出口貨物占當期全部貨物銷售額50％以上，計算應退稅額的公式是：
①當出口貨物離岸價5外匯人民幣牌價5退稅率≥未抵扣完的當期進項稅額時，
退稅額=未抵扣完的當期進項稅額
②當出口貨物離岸價*外匯人民幣牌價*退稅率<未抵扣完的進項稅額時，
退稅額=出口貨物離岸價*外匯人民幣牌價*退稅率
結轉下期的進項稅額＝當期未抵扣完的進項稅額一應退稅額
在運用上述抵、退稅公式時要注意三點：一是，公式中的“當期”均指一個季度，這就是說，計算抵、退稅要以一個季度內的有關數(shù)據(jù)核算；二是，企業(yè)出口額小于當期全部銷售額50％的，對當期未抵扣完的進項稅額不能計算退稅，只能結轉下期抵扣；三是，上述辦法只適用于有進出口經(jīng)營權的生產(chǎn)企業(yè)，不適用外貿(mào)企業(yè)和特定的準予出口退稅的企業(yè)，這類企業(yè)適用下述第3、第4計算辦法。
2． 對于未按照“免、抵、退、”辦法辦理出口退稅的生產(chǎn)企業(yè)（不限于有進出口經(jīng)營權），1995年7月1日以后報關離境直接出口或委托代理出口的貨物，一律先按照增值稅條例的規(guī)定征稅，然后由主管出口退稅的稅務機關在國家出口退稅計劃內依照規(guī)定的退稅率審批退稅。納稅和退稅的計算公式是：
當期 當期內銷 外 匯 征稅 當期全
應納 = 貨物的銷 + 人 民 * - 部進項
稅額 項 稅 金 幣牌價 稅率 稅 額
當期 當期出 外 匯
應退 = 口貨物 * 人民幣 * 退稅率
稅額 離岸價 牌 價
除上述《若干問題規(guī)定》確定的僅對生產(chǎn)企業(yè)適用的兩種出口退稅計算辦法外，對其他企業(yè)，如外貿(mào)企業(yè)、特定準予出口退稅的企業(yè)等，其退稅計算辦法仍按原《出口貨物退（免）稅管理辦法》的規(guī)定執(zhí)行。
3．對有進出口經(jīng)營權的外貿(mào)企業(yè)收購貨物直接出口或委托其他外貿(mào)企業(yè)代理出口貨物的，應依據(jù)購進出口貨物所取得的增值稅專用發(fā)票上列明的進項金額和該貨物適用的退稅率計算退稅。其公式是：
應退稅額＝購進貨物的進項金額*退稅率
對出口貨物庫存賬和銷售賬均采用加權平均價核算的企業(yè)，也可以按適用不同退稅率的貨物，分別依下列公式計算應退稅額：
應退稅額＝出口貨物數(shù)量*加權平均進價*退稅率
外貿(mào)企業(yè)適用上述計算辦法，其前提條件是必須做到對出口貨物單獨設立庫存賬和銷售賬，單獨核算出口貨物的購進金額和進項稅額。如購進的貨物當時不能確定是用于出口或內銷的，一律記入出口庫存賬，內銷時必須從出口庫存賬轉入內銷庫存賬，征稅機關可憑該批貨物的專用發(fā)票或退稅機關出具的退稅證明辦理內銷貨物進項稅額的抵扣。
4．對從事對外承包項目、對外承接修理修配業(yè)務等4類特定企業(yè)出口貨物，特準退（免）稅的計算方法是：按購進貨物的增值稅專用發(fā)票列明的進項金額和規(guī)定的退稅率計算退稅，其公式是：
應退稅額=購進貨物的進項金額*退稅率
5．對出口企業(yè)從小規(guī)模納稅人購進特準退（免）稅貨物出口的，由于小規(guī)模納稅人開具的是普通發(fā)票，發(fā)票所列銷售額含增值稅，因此，其退稅計算公式為：
應退稅額＝普通發(fā)票所列含稅銷售額÷（1＋征收率6％）×退稅率
這里需要注意的是，公式中退稅率有6％和3％兩種，當特準退稅的貨物屬于以農(nóng)產(chǎn)品為原料加工生產(chǎn)的工業(yè)品和適用13％增值稅稅率的其他貨物，以及適用17％增值稅稅率的貨物的范圍時，退稅率為6％；當從小規(guī)模納稅人購進特準退稅的貨物屬于農(nóng)產(chǎn)品范圍時，則退稅率必須是3％。
另一種計算辦法是：出口企業(yè)將出口貨物單獨設立庫存賬和銷售賬記載的，就依據(jù)購進出口貨物增值稅專用發(fā)票所列明的進項金額和退稅率計算應退稅額。由于運用這種辦法是對購進的出口貨物先繳稅，然后再納入國家出口退稅計劃審批退稅，因此，簡稱為“先征后退”辦法，主要適用于未按第一種“免、抵、退”辦法退稅的其他生產(chǎn)企業(yè)和外貿(mào)企業(yè)。
1995年，國務院調低退稅率后，財政部、國家稅務總局頒發(fā)的《出口貨物退（免）稅若干問題規(guī)定》對上述退稅辦法作了一定的修改。經(jīng)修改后從1995年7月1日起執(zhí)行的退稅辦法如下：
1．對確定為按“免、抵、退”辦法辦理出口退稅的有進出口經(jīng)營權的生產(chǎn)企業(yè)和1994年1月1日以后批準設立的外商投資企業(yè)，在1995年7月1日以后報關離境直接出口或委托代理出口的自產(chǎn)貨物，其辦理出口退（免）稅的程序是：
（1）免征出口環(huán)節(jié)增值稅；
（2）按該貨物所適用的增值稅稅率與其所適用的退稅率之差乘以出口貨物的離岸價格折合人民幣的金額，計算出口貨物不予抵扣或退稅的稅額，從當期（是指一個季度內，下同）全部進項稅額中剔除，計入產(chǎn)品成本；
（3）用剔除后的進項稅額余額，抵扣內銷貨物的銷項稅額，計算當期應納稅額；
（4）如果當期應納稅額為負數(shù)，且該企業(yè)出口貨物占當期全部貨物銷售額50％以上，則對當期未抵扣完的進項稅額按公式計算應退稅額：如果該企業(yè)出口貨物占當期全部貨物銷售額50％以下，則對當期未抵扣完的進項稅額結轉下期繼續(xù)抵扣，不予辦理退稅。
上述(2)(3)(4)項抵、退稅計算具體步驟及公式是：
當期不予 當期出 外匯 增值稅出口
抵扣或退 = 口貨物 * 人民幣 * （ 條例規(guī) - 貨 物）
稅的稅額 離岸價 牌價 定的稅率 退稅率
當期 當期內銷 當期全 當期不予 上期末抵
應納= 貨物的銷- （ 部進項 - 抵扣或退 ） - 扣完的進
稅額 項 稅 額 稅 額 稅的稅額 項 稅 額
若當期應納稅額為負數(shù)，也就是說，當期還有未抵扣完的進項稅額，且該企業(yè)出口貨物占當期全部貨物銷售額50％以上，計算應退稅額的公式是：
①當出口貨物離岸價5外匯人民幣牌價5退稅率≥未抵扣完的當期進項稅額時，
退稅額=未抵扣完的當期進項稅額
②當出口貨物離岸價*外匯人民幣牌價*退稅率<未抵扣完的進項稅額時，
退稅額=出口貨物離岸價*外匯人民幣牌價*退稅率
結轉下期的進項稅額＝當期未抵扣完的進項稅額一應退稅額
在運用上述抵、退稅公式時要注意三點：一是，公式中的“當期”均指一個季度，這就是說，計算抵、退稅要以一個季度內的有關數(shù)據(jù)核算；二是，企業(yè)出口額小于當期全部銷售額50％的，對當期未抵扣完的進項稅額不能計算退稅，只能結轉下期抵扣；三是，上述辦法只適用于有進出口經(jīng)營權的生產(chǎn)企業(yè)，不適用外貿(mào)企業(yè)和特定的準予出口退稅的企業(yè)，這類企業(yè)適用下述第3、第4計算辦法。
2． 對于未按照“免、抵、退、”辦法辦理出口退稅的生產(chǎn)企業(yè)（不限于有進出口經(jīng)營權），1995年7月1日以后報關離境直接出口或委托代理出口的貨物，一律先按照增值稅條例的規(guī)定征稅，然后由主管出口退稅的稅務機關在國家出口退稅計劃內依照規(guī)定的退稅率審批退稅。納稅和退稅的計算公式是：
當期 當期內銷 外 匯 征稅 當期全
應納 = 貨物的銷 + 人 民 * - 部進項
稅額 項 稅 金 幣牌價 稅率 稅 額
當期 當期出 外 匯
應退 = 口貨物 * 人民幣 * 退稅率
稅額 離岸價 牌 價
除上述《若干問題規(guī)定》確定的僅對生產(chǎn)企業(yè)適用的兩種出口退稅計算辦法外，對其他企業(yè)，如外貿(mào)企業(yè)、特定準予出口退稅的企業(yè)等，其退稅計算辦法仍按原《出口貨物退（免）稅管理辦法》的規(guī)定執(zhí)行。
3．對有進出口經(jīng)營權的外貿(mào)企業(yè)收購貨物直接出口或委托其他外貿(mào)企業(yè)代理出口貨物的，應依據(jù)購進出口貨物所取得的增值稅專用發(fā)票上列明的進項金額和該貨物適用的退稅率計算退稅。其公式是：
應退稅額＝購進貨物的進項金額*退稅率
對出口貨物庫存賬和銷售賬均采用加權平均價核算的企業(yè)，也可以按適用不同退稅率的貨物，分別依下列公式計算應退稅額：
應退稅額＝出口貨物數(shù)量*加權平均進價*退稅率
外貿(mào)企業(yè)適用上述計算辦法，其前提條件是必須做到對出口貨物單獨設立庫存賬和銷售賬，單獨核算出口貨物的購進金額和進項稅額。如購進的貨物當時不能確定是用于出口或內銷的，一律記入出口庫存賬，內銷時必須從出口庫存賬轉入內銷庫存賬，征稅機關可憑該批貨物的專用發(fā)票或退稅機關出具的退稅證明辦理內銷貨物進項稅額的抵扣。
4．對從事對外承包項目、對外承接修理修配業(yè)務等4類特定企業(yè)出口貨物，特準退（免）稅的計算方法是：按購進貨物的增值稅專用發(fā)票列明的進項金額和規(guī)定的退稅率計算退稅，其公式是：
應退稅額=購進貨物的進項金額*退稅率
5．對出口企業(yè)從小規(guī)模納稅人購進特準退（免）稅貨物出口的，由于小規(guī)模納稅人開具的是普通發(fā)票，發(fā)票所列銷售額含增值稅，因此，其退稅計算公式為：
應退稅額＝普通發(fā)票所列含稅銷售額÷（1＋征收率6％）×退稅率
這里需要注意的是，公式中退稅率有6％和3％兩種，當特準退稅的貨物屬于以農(nóng)產(chǎn)品為原料加工生產(chǎn)的工業(yè)品和適用13％增值稅稅率的其他貨物，以及適用17％增值稅稅率的貨物的范圍時，退稅率為6％；當從小規(guī)模納稅人購進特準退稅的貨物屬于農(nóng)產(chǎn)品范圍時，則退稅率必須是3％。