（一）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)審計(jì)項(xiàng)目計(jì)劃、審計(jì)工作內(nèi)部分工管理產(chǎn)生影響
按照現(xiàn)行審計(jì)工作內(nèi)部分工管理的做法，在審計(jì)機(jī)關(guān)內(nèi)部分別設(shè)置了行政事業(yè)與社會(huì)保障審計(jì)、農(nóng)業(yè)與資源環(huán)保審計(jì)、財(cái)政金融審計(jì)、固定資產(chǎn)投資審計(jì)、領(lǐng)導(dǎo)干部經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)等即分工又協(xié)作的職能機(jī)構(gòu)，分別按行業(yè)對(duì)有關(guān)單位和資金進(jìn)行審計(jì)，除領(lǐng)導(dǎo)干部經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)有一定的特殊性外，原則上每年的審計(jì)計(jì)劃項(xiàng)目都不會(huì)是重復(fù)的，日常審計(jì)工作一般是獨(dú)立成立審計(jì)組開(kāi)展工作，而且工作各有側(cè)重，有的是全面的財(cái)政、財(cái)務(wù)收支審計(jì)；有的是某個(gè)專項(xiàng)資金審計(jì)或?qū)徲?jì)調(diào)查。在未實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算前，各審計(jì)組分散在各有關(guān)單位開(kāi)展審計(jì)，但在實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，會(huì)較多地出現(xiàn)同一審計(jì)機(jī)關(guān)多個(gè)審計(jì)組在會(huì)計(jì)核算中心審查、調(diào)閱有關(guān)單位會(huì)計(jì)資料進(jìn)行審計(jì)的情況。這種狀況如不改變，勢(shì)必影響會(huì)計(jì)核算中心的日常工作，同時(shí)對(duì)審計(jì)機(jī)關(guān)的內(nèi)部分工管理、制定審計(jì)項(xiàng)目計(jì)劃帶來(lái)影響。
（二）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)真實(shí)性、合規(guī)性審計(jì)產(chǎn)生影響
審計(jì)主要是通過(guò)對(duì)有關(guān)部門(mén)、單位財(cái)政收支、財(cái)務(wù)收支的真實(shí)性、合規(guī)性、效益性的審計(jì)，從而實(shí)現(xiàn)其監(jiān)督目的的。在實(shí)現(xiàn)會(huì)計(jì)集中核算后，單位的一些違反財(cái)經(jīng)法紀(jì)的事項(xiàng)為了達(dá)到在會(huì)計(jì)核算中心順利審核過(guò)關(guān)并報(bào)賬的目的，往往會(huì)想方設(shè)法完備有關(guān)的手續(xù)，而會(huì)計(jì)核算中心審核報(bào)賬后，即使這種經(jīng)濟(jì)事項(xiàng)的會(huì)計(jì)核算處理融入了繁多的會(huì)計(jì)核算業(yè)務(wù)之中，為真實(shí)性、合規(guī)性審計(jì)增加了難度。此外，會(huì)計(jì)核算中心的審核，因多種因素的影響，在客觀上增加了審計(jì)對(duì)其審核的信賴，容易產(chǎn)生認(rèn)同感，從而也會(huì)影響到審計(jì)人員對(duì)審計(jì)事項(xiàng)真實(shí)、合規(guī)性的專業(yè)判斷的準(zhǔn)確性。這些因素的存在都會(huì)導(dǎo)致審計(jì)風(fēng)險(xiǎn)的加大。
（三）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)審計(jì)質(zhì)量管理產(chǎn)生影響
為了加大審計(jì)監(jiān)督力度，對(duì)被審計(jì)事項(xiàng)查深查透，提高審計(jì)質(zhì)量，各地審計(jì)機(jī)關(guān)都實(shí)行了審計(jì)質(zhì)量管理，有的地方還制定了一些制度規(guī)章，如：對(duì)庫(kù)存現(xiàn)金、有價(jià)證券等資產(chǎn)必審；對(duì)銀行賬號(hào)、對(duì)賬單和余額調(diào)節(jié)表必審；對(duì)票據(jù)、收據(jù)存根必審；對(duì)未納入?yún)R總報(bào)表或未報(bào)送報(bào)表的單位必審；對(duì)賬表、賬賬、賬證的平衡銜接關(guān)系必審；對(duì)往來(lái)賬戶必審。實(shí)踐表明，這些審計(jì)質(zhì)量管理辦法行之有效，為切實(shí)提升審計(jì)監(jiān)督的質(zhì)量發(fā)揮積極作用。但實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)此將產(chǎn)生一些影響。如對(duì)單位收入的審計(jì)，發(fā)票存根和會(huì)計(jì)記賬聯(lián)保存部門(mén)和地點(diǎn)不在同一處，勾稽核對(duì)不如以前方便，同時(shí)會(huì)計(jì)核算中心也進(jìn)行了必要的審核，審計(jì)人員較易忽視或放棄，而進(jìn)行這項(xiàng)工作恰恰是收入審計(jì)的關(guān)鍵點(diǎn)之一；再如對(duì)表外單位的審計(jì)，一個(gè)很重要的辦法是通過(guò)表外單位與單位的經(jīng)濟(jì)活動(dòng)往來(lái)以及與單位的其他緊密聯(lián)系程度來(lái)進(jìn)行審計(jì)，實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，使得有些事項(xiàng)分離脫節(jié)，審計(jì)變得復(fù)雜化，從而影響審計(jì)的結(jié)果。
（四）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)審計(jì)工作的效率和審計(jì)成本產(chǎn)生影響
實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，各有關(guān)單位的財(cái)政、財(cái)務(wù)收支核算和有關(guān)會(huì)計(jì)資料在會(huì)計(jì)核算中心，審計(jì)監(jiān)督主要是通過(guò)對(duì)會(huì)計(jì)資料的審計(jì)來(lái)進(jìn)行的，但它是“死賬”，僅對(duì)其進(jìn)行審計(jì)是難以達(dá)到深層次的有效監(jiān)督的，更多的是以“死賬”為基礎(chǔ)查“活賬”，也就是對(duì)與會(huì)計(jì)賬相關(guān)的一些其他經(jīng)濟(jì)事項(xiàng)的審計(jì)，這是坐在會(huì)計(jì)核算中心進(jìn)行審計(jì)無(wú)法實(shí)現(xiàn)的，有必要仍像以前那樣經(jīng)歷查“死賬”—查“活賬”—查“死賬”的過(guò)程，就必須從會(huì)計(jì)核算中心—單位—會(huì)計(jì)核算中心來(lái)去反反復(fù)復(fù)，會(huì)計(jì)核算中心和單位辦公不在同一地點(diǎn)，客觀上會(huì)增加審計(jì)成本，降低審計(jì)工作效率。
（五）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)審計(jì)依法作出準(zhǔn)確的處理處罰和中肯的審計(jì)評(píng)價(jià)產(chǎn)生影響
實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算的單位，其財(cái)務(wù)收支在會(huì)計(jì)核算中心報(bào)賬，是通過(guò)該中心較為嚴(yán)格的審核的。這種審核可以認(rèn)為既是一種會(huì)計(jì)監(jiān)督，又是一種財(cái)政監(jiān)督。同時(shí)從某種意義上講也是一種政府監(jiān)督。經(jīng)過(guò)了監(jiān)督，單位的財(cái)務(wù)收支行為理應(yīng)是合規(guī)、合法而且真實(shí)的。但是這些監(jiān)督不能代表審計(jì)監(jiān)督，這就為審計(jì)認(rèn)定責(zé)任，明確處罰主體增加了困難。同時(shí)，有關(guān)會(huì)計(jì)集中核算的規(guī)定沒(méi)有法律層次的權(quán)威規(guī)范，某些提法與《會(huì)計(jì)法》有相矛盾之處，這使得審計(jì)的處理處罰和審計(jì)對(duì)責(zé)任的界定評(píng)價(jià)缺乏充分的法律依據(jù)。
（六）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)審計(jì)技術(shù)方法手段產(chǎn)生影響
實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，使得審計(jì)機(jī)關(guān)多年探索總結(jié)的一整套技術(shù)方法不再完全實(shí)用。如審計(jì)程序的執(zhí)行、會(huì)計(jì)資料的收集和取得、審計(jì)報(bào)告征求意見(jiàn)的形式、審計(jì)意見(jiàn)書(shū)和審計(jì)決定的下達(dá)方式、審計(jì)收繳款的入庫(kù)、審計(jì)意見(jiàn)和建議的落實(shí)都會(huì)發(fā)生變化。單位違反財(cái)經(jīng)紀(jì)律的問(wèn)題更具隱蔽性和欺騙性，發(fā)現(xiàn)問(wèn)題的難度加大，更需要大量的查“活賬”?！秾徲?jì)法》賦予審計(jì)的職能手段本來(lái)就有限，在實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算前，審計(jì)工作中就顯現(xiàn)出審計(jì)職能手段缺乏，使一些審計(jì)事項(xiàng)無(wú)法深入的弊端，借助與其他職能部門(mén)的聯(lián)手，又常常缺乏整體性和有機(jī)性。實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，審計(jì)面對(duì)更多的查“活賬”任務(wù)，審計(jì)的職能手段缺乏將更加凸現(xiàn)出來(lái)。
按照現(xiàn)行審計(jì)工作內(nèi)部分工管理的做法，在審計(jì)機(jī)關(guān)內(nèi)部分別設(shè)置了行政事業(yè)與社會(huì)保障審計(jì)、農(nóng)業(yè)與資源環(huán)保審計(jì)、財(cái)政金融審計(jì)、固定資產(chǎn)投資審計(jì)、領(lǐng)導(dǎo)干部經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)等即分工又協(xié)作的職能機(jī)構(gòu)，分別按行業(yè)對(duì)有關(guān)單位和資金進(jìn)行審計(jì)，除領(lǐng)導(dǎo)干部經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)有一定的特殊性外，原則上每年的審計(jì)計(jì)劃項(xiàng)目都不會(huì)是重復(fù)的，日常審計(jì)工作一般是獨(dú)立成立審計(jì)組開(kāi)展工作，而且工作各有側(cè)重，有的是全面的財(cái)政、財(cái)務(wù)收支審計(jì)；有的是某個(gè)專項(xiàng)資金審計(jì)或?qū)徲?jì)調(diào)查。在未實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算前，各審計(jì)組分散在各有關(guān)單位開(kāi)展審計(jì)，但在實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，會(huì)較多地出現(xiàn)同一審計(jì)機(jī)關(guān)多個(gè)審計(jì)組在會(huì)計(jì)核算中心審查、調(diào)閱有關(guān)單位會(huì)計(jì)資料進(jìn)行審計(jì)的情況。這種狀況如不改變，勢(shì)必影響會(huì)計(jì)核算中心的日常工作，同時(shí)對(duì)審計(jì)機(jī)關(guān)的內(nèi)部分工管理、制定審計(jì)項(xiàng)目計(jì)劃帶來(lái)影響。
（二）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)真實(shí)性、合規(guī)性審計(jì)產(chǎn)生影響
審計(jì)主要是通過(guò)對(duì)有關(guān)部門(mén)、單位財(cái)政收支、財(cái)務(wù)收支的真實(shí)性、合規(guī)性、效益性的審計(jì)，從而實(shí)現(xiàn)其監(jiān)督目的的。在實(shí)現(xiàn)會(huì)計(jì)集中核算后，單位的一些違反財(cái)經(jīng)法紀(jì)的事項(xiàng)為了達(dá)到在會(huì)計(jì)核算中心順利審核過(guò)關(guān)并報(bào)賬的目的，往往會(huì)想方設(shè)法完備有關(guān)的手續(xù)，而會(huì)計(jì)核算中心審核報(bào)賬后，即使這種經(jīng)濟(jì)事項(xiàng)的會(huì)計(jì)核算處理融入了繁多的會(huì)計(jì)核算業(yè)務(wù)之中，為真實(shí)性、合規(guī)性審計(jì)增加了難度。此外，會(huì)計(jì)核算中心的審核，因多種因素的影響，在客觀上增加了審計(jì)對(duì)其審核的信賴，容易產(chǎn)生認(rèn)同感，從而也會(huì)影響到審計(jì)人員對(duì)審計(jì)事項(xiàng)真實(shí)、合規(guī)性的專業(yè)判斷的準(zhǔn)確性。這些因素的存在都會(huì)導(dǎo)致審計(jì)風(fēng)險(xiǎn)的加大。
（三）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)審計(jì)質(zhì)量管理產(chǎn)生影響
為了加大審計(jì)監(jiān)督力度，對(duì)被審計(jì)事項(xiàng)查深查透，提高審計(jì)質(zhì)量，各地審計(jì)機(jī)關(guān)都實(shí)行了審計(jì)質(zhì)量管理，有的地方還制定了一些制度規(guī)章，如：對(duì)庫(kù)存現(xiàn)金、有價(jià)證券等資產(chǎn)必審；對(duì)銀行賬號(hào)、對(duì)賬單和余額調(diào)節(jié)表必審；對(duì)票據(jù)、收據(jù)存根必審；對(duì)未納入?yún)R總報(bào)表或未報(bào)送報(bào)表的單位必審；對(duì)賬表、賬賬、賬證的平衡銜接關(guān)系必審；對(duì)往來(lái)賬戶必審。實(shí)踐表明，這些審計(jì)質(zhì)量管理辦法行之有效，為切實(shí)提升審計(jì)監(jiān)督的質(zhì)量發(fā)揮積極作用。但實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)此將產(chǎn)生一些影響。如對(duì)單位收入的審計(jì)，發(fā)票存根和會(huì)計(jì)記賬聯(lián)保存部門(mén)和地點(diǎn)不在同一處，勾稽核對(duì)不如以前方便，同時(shí)會(huì)計(jì)核算中心也進(jìn)行了必要的審核，審計(jì)人員較易忽視或放棄，而進(jìn)行這項(xiàng)工作恰恰是收入審計(jì)的關(guān)鍵點(diǎn)之一；再如對(duì)表外單位的審計(jì)，一個(gè)很重要的辦法是通過(guò)表外單位與單位的經(jīng)濟(jì)活動(dòng)往來(lái)以及與單位的其他緊密聯(lián)系程度來(lái)進(jìn)行審計(jì)，實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，使得有些事項(xiàng)分離脫節(jié)，審計(jì)變得復(fù)雜化，從而影響審計(jì)的結(jié)果。
（四）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)審計(jì)工作的效率和審計(jì)成本產(chǎn)生影響
實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，各有關(guān)單位的財(cái)政、財(cái)務(wù)收支核算和有關(guān)會(huì)計(jì)資料在會(huì)計(jì)核算中心，審計(jì)監(jiān)督主要是通過(guò)對(duì)會(huì)計(jì)資料的審計(jì)來(lái)進(jìn)行的，但它是“死賬”，僅對(duì)其進(jìn)行審計(jì)是難以達(dá)到深層次的有效監(jiān)督的，更多的是以“死賬”為基礎(chǔ)查“活賬”，也就是對(duì)與會(huì)計(jì)賬相關(guān)的一些其他經(jīng)濟(jì)事項(xiàng)的審計(jì)，這是坐在會(huì)計(jì)核算中心進(jìn)行審計(jì)無(wú)法實(shí)現(xiàn)的，有必要仍像以前那樣經(jīng)歷查“死賬”—查“活賬”—查“死賬”的過(guò)程，就必須從會(huì)計(jì)核算中心—單位—會(huì)計(jì)核算中心來(lái)去反反復(fù)復(fù)，會(huì)計(jì)核算中心和單位辦公不在同一地點(diǎn)，客觀上會(huì)增加審計(jì)成本，降低審計(jì)工作效率。
（五）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)審計(jì)依法作出準(zhǔn)確的處理處罰和中肯的審計(jì)評(píng)價(jià)產(chǎn)生影響
實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算的單位，其財(cái)務(wù)收支在會(huì)計(jì)核算中心報(bào)賬，是通過(guò)該中心較為嚴(yán)格的審核的。這種審核可以認(rèn)為既是一種會(huì)計(jì)監(jiān)督，又是一種財(cái)政監(jiān)督。同時(shí)從某種意義上講也是一種政府監(jiān)督。經(jīng)過(guò)了監(jiān)督，單位的財(cái)務(wù)收支行為理應(yīng)是合規(guī)、合法而且真實(shí)的。但是這些監(jiān)督不能代表審計(jì)監(jiān)督，這就為審計(jì)認(rèn)定責(zé)任，明確處罰主體增加了困難。同時(shí)，有關(guān)會(huì)計(jì)集中核算的規(guī)定沒(méi)有法律層次的權(quán)威規(guī)范，某些提法與《會(huì)計(jì)法》有相矛盾之處，這使得審計(jì)的處理處罰和審計(jì)對(duì)責(zé)任的界定評(píng)價(jià)缺乏充分的法律依據(jù)。
（六）實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，對(duì)審計(jì)技術(shù)方法手段產(chǎn)生影響
實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，使得審計(jì)機(jī)關(guān)多年探索總結(jié)的一整套技術(shù)方法不再完全實(shí)用。如審計(jì)程序的執(zhí)行、會(huì)計(jì)資料的收集和取得、審計(jì)報(bào)告征求意見(jiàn)的形式、審計(jì)意見(jiàn)書(shū)和審計(jì)決定的下達(dá)方式、審計(jì)收繳款的入庫(kù)、審計(jì)意見(jiàn)和建議的落實(shí)都會(huì)發(fā)生變化。單位違反財(cái)經(jīng)紀(jì)律的問(wèn)題更具隱蔽性和欺騙性，發(fā)現(xiàn)問(wèn)題的難度加大，更需要大量的查“活賬”?！秾徲?jì)法》賦予審計(jì)的職能手段本來(lái)就有限，在實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算前，審計(jì)工作中就顯現(xiàn)出審計(jì)職能手段缺乏，使一些審計(jì)事項(xiàng)無(wú)法深入的弊端，借助與其他職能部門(mén)的聯(lián)手，又常常缺乏整體性和有機(jī)性。實(shí)行會(huì)計(jì)集中核算后，審計(jì)面對(duì)更多的查“活賬”任務(wù)，審計(jì)的職能手段缺乏將更加凸現(xiàn)出來(lái)。