這些特殊區(qū)域指保稅區(qū)、出口加工區(qū)。報檢范圍同前述。
一、保稅區(qū)：基本上按照一般報檢辦理，特例如下。
1、區(qū)內(nèi)企業(yè)間銷售、轉(zhuǎn)移貨物及其包裝物、鋪墊材料、運輸工具、集裝箱，免檢。
2、境外進區(qū)貨物，屬衛(wèi)生檢疫和動植物檢疫的，必須進行動植物和衛(wèi)生檢疫。如果是用作原料的固體廢物、舊機電產(chǎn)品、成套設(shè)備，則施檢并監(jiān)管。如系外商投資財產(chǎn)，作價值鑒定。
3、境外進區(qū)的倉儲物流貨物，以及自用辦公用品、出口加工料件，都需要強制性產(chǎn)品認證。
4、境內(nèi)區(qū)外進區(qū)，不須報檢施檢。
5、出區(qū)出境，報檢施檢。出區(qū)進境，免檢，除非
a、需要食品衛(wèi)生監(jiān)督檢驗，而檢疫的。
b、列入強制性產(chǎn)品認證目錄的，需要驗證證書、驗明產(chǎn)品上的認證標志。
c、預(yù)包裝食品、化妝品，需要辦理標簽審核手續(xù)。
e、境內(nèi)進區(qū)然后出境的，可以持產(chǎn)地局簽發(fā)的換證憑單，換領(lǐng)《單》，不施檢放行。無產(chǎn)地檢驗，保稅區(qū)辦理檢驗檢疫。
6、保稅區(qū)轉(zhuǎn)口法檢對象，如包裝密封良好、直接轉(zhuǎn)口，則入境時只需外包裝檢疫、必要的消毒處理；如需簡單加工或包裝不良，然后轉(zhuǎn)口的，需要動植物檢疫、衛(wèi)生檢疫；如轉(zhuǎn)口貨物為動植物、動植物產(chǎn)品、其他檢疫物，入境報檢時需要提交輸出國的官方檢疫證書；如系動物，再加交國家質(zhì)檢總局簽發(fā)的《動物過境許可證》、輸入國允許進境證明；如系轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品，則需要加交國家質(zhì)檢總局簽發(fā)的《轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品過境轉(zhuǎn)移許可證》。
7、轉(zhuǎn)口貨物出區(qū)出境，免報免驗。
二、出口加工區(qū)：
1、加工料件和區(qū)內(nèi)自用辦公、生活用品，免予“品質(zhì)”檢疫。但以廢物為原料的，必須實施“環(huán)保”檢驗。
2、“法檢”貨物、集裝箱、運輸工具，必須“衛(wèi)生”檢疫；如果貨物為動植物、產(chǎn)品及其他檢疫物，則進行動植物檢疫；如果貨物、集裝箱、運輸工具來自疫區(qū)或發(fā)現(xiàn)嚙齒類動物、病媒昆蟲，則繼續(xù)進行衛(wèi)生處理。
3、中外合資、合作企業(yè)以及補償貿(mào)易中的投資設(shè)備，必須進行“價值鑒定”。
4、區(qū)內(nèi)出境的下列產(chǎn)品，必須申請“品質(zhì)檢驗”或“食品衛(wèi)生檢驗”。
a、表明中國制造的
b、使用中國注冊商標的
c、申領(lǐng)中國原產(chǎn)地證明的
d、需要檢驗檢疫機構(gòu)出具“品質(zhì)證書”或“食品衛(wèi)生證書”的
5、區(qū)外運入?yún)^(qū)內(nèi)，免予檢驗檢疫。但
6、區(qū)內(nèi)運出到區(qū)外，則：
a、屬商品檢驗范圍的，申報“品質(zhì)檢驗”；
b、屬食品衛(wèi)生檢驗范圍的，申報“食品衛(wèi)生檢驗”； （慎重的結(jié)果）
c、屬強制認證目錄內(nèi)的產(chǎn)品，申領(lǐng)“強制性產(chǎn)品認證證書”或“免*明”；
d、如系廢料、舊機電，必須申報“環(huán)保檢驗”。
e、屬動植物檢驗檢疫范圍的，免
f、屬衛(wèi)生檢疫范圍的，免
三、邊境貿(mào)易：（指：邊境互市貿(mào)易、邊境小額貿(mào)易）
1、邊境貿(mào)易進出口貨物、包裝材料、運輸工具和集裝箱，均列入報檢范圍。
2、小額貿(mào)易的報檢施檢手續(xù)同一般貿(mào)易貨物；互市貿(mào)易則簡單
3、小額貿(mào)易提交的單據(jù)參見前述。
第八節(jié)檢驗檢疫收費
一、法律依據(jù)：四法及其實施條例； 世貿(mào)有關(guān)協(xié)議
二、收費原則：統(tǒng)一制定（發(fā)改委、財政部）、簡化減少、公開透明、公正合理。
三、除了檢驗檢疫機構(gòu)收取出入境檢驗檢疫費用外，任何單位和個人不得收取。
一、保稅區(qū)：基本上按照一般報檢辦理，特例如下。
1、區(qū)內(nèi)企業(yè)間銷售、轉(zhuǎn)移貨物及其包裝物、鋪墊材料、運輸工具、集裝箱，免檢。
2、境外進區(qū)貨物，屬衛(wèi)生檢疫和動植物檢疫的，必須進行動植物和衛(wèi)生檢疫。如果是用作原料的固體廢物、舊機電產(chǎn)品、成套設(shè)備，則施檢并監(jiān)管。如系外商投資財產(chǎn)，作價值鑒定。
3、境外進區(qū)的倉儲物流貨物，以及自用辦公用品、出口加工料件，都需要強制性產(chǎn)品認證。
4、境內(nèi)區(qū)外進區(qū)，不須報檢施檢。
5、出區(qū)出境，報檢施檢。出區(qū)進境，免檢，除非
a、需要食品衛(wèi)生監(jiān)督檢驗，而檢疫的。
b、列入強制性產(chǎn)品認證目錄的，需要驗證證書、驗明產(chǎn)品上的認證標志。
c、預(yù)包裝食品、化妝品，需要辦理標簽審核手續(xù)。
e、境內(nèi)進區(qū)然后出境的，可以持產(chǎn)地局簽發(fā)的換證憑單，換領(lǐng)《單》，不施檢放行。無產(chǎn)地檢驗，保稅區(qū)辦理檢驗檢疫。
6、保稅區(qū)轉(zhuǎn)口法檢對象，如包裝密封良好、直接轉(zhuǎn)口，則入境時只需外包裝檢疫、必要的消毒處理；如需簡單加工或包裝不良，然后轉(zhuǎn)口的，需要動植物檢疫、衛(wèi)生檢疫；如轉(zhuǎn)口貨物為動植物、動植物產(chǎn)品、其他檢疫物，入境報檢時需要提交輸出國的官方檢疫證書；如系動物，再加交國家質(zhì)檢總局簽發(fā)的《動物過境許可證》、輸入國允許進境證明；如系轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品，則需要加交國家質(zhì)檢總局簽發(fā)的《轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品過境轉(zhuǎn)移許可證》。
7、轉(zhuǎn)口貨物出區(qū)出境，免報免驗。
二、出口加工區(qū)：
1、加工料件和區(qū)內(nèi)自用辦公、生活用品，免予“品質(zhì)”檢疫。但以廢物為原料的，必須實施“環(huán)保”檢驗。
2、“法檢”貨物、集裝箱、運輸工具，必須“衛(wèi)生”檢疫；如果貨物為動植物、產(chǎn)品及其他檢疫物，則進行動植物檢疫；如果貨物、集裝箱、運輸工具來自疫區(qū)或發(fā)現(xiàn)嚙齒類動物、病媒昆蟲，則繼續(xù)進行衛(wèi)生處理。
3、中外合資、合作企業(yè)以及補償貿(mào)易中的投資設(shè)備，必須進行“價值鑒定”。
4、區(qū)內(nèi)出境的下列產(chǎn)品，必須申請“品質(zhì)檢驗”或“食品衛(wèi)生檢驗”。
a、表明中國制造的
b、使用中國注冊商標的
c、申領(lǐng)中國原產(chǎn)地證明的
d、需要檢驗檢疫機構(gòu)出具“品質(zhì)證書”或“食品衛(wèi)生證書”的
5、區(qū)外運入?yún)^(qū)內(nèi)，免予檢驗檢疫。但
6、區(qū)內(nèi)運出到區(qū)外，則：
a、屬商品檢驗范圍的，申報“品質(zhì)檢驗”；
b、屬食品衛(wèi)生檢驗范圍的，申報“食品衛(wèi)生檢驗”； （慎重的結(jié)果）
c、屬強制認證目錄內(nèi)的產(chǎn)品，申領(lǐng)“強制性產(chǎn)品認證證書”或“免*明”；
d、如系廢料、舊機電，必須申報“環(huán)保檢驗”。
e、屬動植物檢驗檢疫范圍的，免
f、屬衛(wèi)生檢疫范圍的，免
三、邊境貿(mào)易：（指：邊境互市貿(mào)易、邊境小額貿(mào)易）
1、邊境貿(mào)易進出口貨物、包裝材料、運輸工具和集裝箱，均列入報檢范圍。
2、小額貿(mào)易的報檢施檢手續(xù)同一般貿(mào)易貨物；互市貿(mào)易則簡單
3、小額貿(mào)易提交的單據(jù)參見前述。
第八節(jié)檢驗檢疫收費
一、法律依據(jù)：四法及其實施條例； 世貿(mào)有關(guān)協(xié)議
二、收費原則：統(tǒng)一制定（發(fā)改委、財政部）、簡化減少、公開透明、公正合理。
三、除了檢驗檢疫機構(gòu)收取出入境檢驗檢疫費用外，任何單位和個人不得收取。