2009年1月1日起，修訂后的《中華人民共和國增值稅暫行條例》及其《實施細則》（以下分別簡稱《增值稅條例》、《實施細則》）正式全面實施。這一重大政策調(diào)整，對于促進企業(yè)技術改造，減輕企業(yè)負擔，增強企業(yè)發(fā)展后勁，克服當前金融危機對國民經(jīng)濟帶來的不利影響具有十分重要的作用和意義。但同時，在增值稅轉型政策的實施中，也表現(xiàn)出了一些問題，這些問題對稅務機關如何強化增值稅管理和積極應對管理中出現(xiàn)的新問題提出了挑戰(zhàn)。
一、增值稅轉型政策實施中存在的問題
（一）企業(yè)可能將增值稅轉型政策實施前購入的固定資產(chǎn)進行抵扣
由于2009年1月1日是固定資產(chǎn)是否允許抵扣的分界點，故部分增值稅一般納稅人（以下簡稱“一般納稅人”）有可能將2009年1月1日以前已購入但尚未索取發(fā)票的機器設備，通過讓銷售方開具2009年1月1日后發(fā)票的方式進行抵扣。這種方式具有很大的隱蔽性，如果僅憑發(fā)票開具時間來確定是否允許抵扣，而不對該項機器設備購進、安裝和使用情況進行專門的調(diào)查核實，很難發(fā)現(xiàn)問題。
（二）企業(yè)可能將增值稅轉型政策實施前購進的固定資產(chǎn)虛假退貨
一般納稅人可能將2009年1月1日以前購入且已索取發(fā)票的機器設備，通過虛構退貨業(yè)務，讓銷售方開具紅字發(fā)票沖減銷售后，再重新開具發(fā)票的方式進行抵扣（此情況基層稅務機關遇到較多）。而小規(guī)模納稅人則可能將2009年1月1日以前銷售的貨物，通過虛構退貨業(yè)務，開具紅字發(fā)票后再重新開具發(fā)票，按新的征收率3%計算稅款而達到少繳增值稅的目的。
（三）企業(yè)可能將非抵扣范圍的固定資產(chǎn)進行抵扣
按照增值稅轉型政策規(guī)定，一般納稅人購進的符合規(guī)定范圍的機器、機械、交通工具等固定資產(chǎn)，可以從當期進項稅額中抵扣。而房屋、建筑物，以及應征消費稅的汽車、摩托車、游艇等是不允許抵扣的。但納稅人可能將購入的應征消費稅的汽車、摩托車、游艇等，通過變換開票產(chǎn)品名稱的方式進行抵扣，或者在建造房屋、基礎設施等非抵扣范圍的固定資產(chǎn)時，將購入的鋼材、水泥等建筑用材料，通過向銷售方索取增值稅專用發(fā)票的方式進行抵扣。
（四）一般納稅人認定標準降低帶來管理難題
修訂后的《實施細則》將工業(yè)和非工業(yè)的一般納稅人年應稅銷售額標準分別由100萬元和180萬元降低至50萬元和80萬元，達到標準的增值稅小規(guī)模納稅人（以下簡稱“小規(guī)模納稅人”）必須申請或者被強制認定為一般納稅人。一般納稅人認定標準“門檻”降低后，一般納稅人數(shù)量將驟然增多，大批財務核算水平相對較低、納稅意識較差的小規(guī)模納稅人將進入一般納稅人的行列。同時，很多毛利率較高、難以取得進項發(fā)票、經(jīng)營百貨日用品等購買方不需要增值稅專用發(fā)票貨物的小規(guī)模納稅人是極不愿意申請或者被強制認定為一般納稅人的。今后稅務機關管理的難度大大增加了。
（五）新修訂的《增值稅條例》依然沒有解決農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票抵扣問題
多年來，國家出于調(diào)動和保護農(nóng)民積極性，解決農(nóng)產(chǎn)品銷售的難題，方便納稅人收購農(nóng)產(chǎn)品時發(fā)票開具，允許從事農(nóng)產(chǎn)品收購的納稅人自行開具農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票并可以抵扣稅款，但其弊端是有目共睹的。例如：收購的品種、數(shù)量、金額等完全由納稅人自行掌握，稅務機關對其收購情況難以核實，管理難度和執(zhí)法風險很大。不法分子利用虛開的農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票虛抵稅款進而使虛開增值稅專用發(fā)票的大案要案不斷發(fā)生，給國家稅收造成了巨大損失。基層稅務機關要求取消農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票和改變現(xiàn)行抵扣政策的呼聲很高，但新修訂的《增值稅條例》和《實施細則》卻依然保留了納稅人憑農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票抵扣稅款的規(guī)定，沒有從根本上解決農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票帶來的弊端。
（六）按簡易辦法征收適用征收率繁雜且法律依據(jù)不足
按照原《增值稅條例》規(guī)定，小規(guī)模納稅人適用6%的征收率，一般納稅人部分貨物比照小規(guī)模納稅人執(zhí)行6%的征收率。后因商業(yè)小規(guī)模納稅人改按4%征收率執(zhí)行，至此次轉型實施前，對一般納稅人部分貨物分別按照6%或4%的征收率執(zhí)行。而按照新修訂的《增值稅條例》規(guī)定，小規(guī)模納稅人的征收率不再區(qū)分工業(yè)和商業(yè)，一律按照3%的征收率執(zhí)行。但目前對一般納稅人部分貨物依然延續(xù)原政策適用6%、4%征收率，甚至有許多適用4%征收率再減半征收的規(guī)定，不僅名目繁多，計算復雜，而且沒有了執(zhí)行的法律依據(jù)。
二、加強增值稅管理的建議
（一）加強對票流、款流、物流的人工審核，做好固定資產(chǎn)抵扣管理
對于納稅人申報抵扣2009年1月1日以后購入固定資產(chǎn)取得的增值稅專用發(fā)票，實行“單獨申報、人工審核”等措施，對票流、款流、物流實施嚴格審核，確定其業(yè)務和發(fā)票開具時限是否為2009年1月1日以后實際發(fā)生。一是票據(jù)流審核，審核其票面貨物所填列名稱，是否屬于抵扣范圍內(nèi)的固定資產(chǎn)，是否屬于納稅人用于生產(chǎn)經(jīng)營的固定資產(chǎn)，審核開具發(fā)票時間與納稅人購貨驗收入庫時間是否一致等；二是資金流審核，審核資金來源和支付的真實性，是否按規(guī)定支付貨款，如是否支付給了增值稅專用發(fā)票所列的銷售企業(yè)，防止從第三方取得發(fā)票：三是實物流審核，深入企業(yè)實地查看實物，驗明生產(chǎn)廠家及具體用途，并與購貨合同等逐項進行核對，防止虛假購進和騙抵稅款。除此之外，還要加強固定資產(chǎn)投入使用情況的后續(xù)跟蹤監(jiān)控。
（二）加強紅字發(fā)票監(jiān)控，嚴格審核退貨真實性
對機器設備銷售企業(yè)和小規(guī)模納稅人在2009年1月1日前后開具的紅字發(fā)票或者開具紅字發(fā)票的申請，要嚴格進行審查，逐份查明原因，審查其是否屬于真實退貨，有無實際收到所退貨物，是否將貨款全部退給購貨方，防止納稅人虛假沖銷以前年度銷售，重新開具增值稅專用發(fā)票給購貨方抵扣稅款，或者重新開具普通發(fā)票，以低征收率3%計算而少繳應繳增值稅。對不符合紅字發(fā)票開具規(guī)定的，嚴格按照發(fā)票管理辦法進行處罰。
（三）規(guī)范一般納稅人資格認定手續(xù)，加強日常控管
雖然一般納稅人認定的銷售額標準降低了，但對一般納稅人財務核算的要求和其他管理要求不能降低，稅務機關應準確把握增值稅管理的一般性要求，依法加強對一般納稅人的認定管理，嚴把一般納稅人認定關口，特別是要嚴格執(zhí)行小規(guī)模納稅人銷售額超標強制認定一般納稅人的規(guī)定。
（四）取消農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票，廢止自開自抵稅款制度
針對當前農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票和納稅人自開自抵稅款帶來的種種弊端，以及這種發(fā)票管理和抵扣制度對稅務機關帶來的執(zhí)法風險，應盡快取消農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票，廢止納稅人自行開具農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票、自行抵扣稅款的規(guī)定。同時，應對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)單位和農(nóng)民個人實行戶籍地管理制度，可以設計一種農(nóng)產(chǎn)品專用銷售發(fā)票。收購農(nóng)產(chǎn)品的納稅人可以憑農(nóng)產(chǎn)品專用銷售發(fā)票抵扣稅款。
（五）依法統(tǒng)一簡易辦法征收率，簡化征收管理
現(xiàn)行《增值稅條例》規(guī)定，增值稅除了基本法定稅率外，只有3%的征收率，除此之外的征收率，都是沒有法律依據(jù)的。因此，應將目前一般納稅人部分貨物按照簡易辦法征稅的征收率6%、4%、3%等統(tǒng)一確定為3%。這樣不僅使一般納稅人部分貨物按簡易辦法征稅適用的征收率有了法律依據(jù)，而且可以簡化稅企雙方的計算和征納。況且從目前的三種征收率適用的部分貨物和征收率之間的差異看，統(tǒng)一按3%征收對稅收的影響甚微（特別是按4%征收率計算，或者按4%征收率減半即2%征收的項目更是如此）。
一、增值稅轉型政策實施中存在的問題
（一）企業(yè)可能將增值稅轉型政策實施前購入的固定資產(chǎn)進行抵扣
由于2009年1月1日是固定資產(chǎn)是否允許抵扣的分界點，故部分增值稅一般納稅人（以下簡稱“一般納稅人”）有可能將2009年1月1日以前已購入但尚未索取發(fā)票的機器設備，通過讓銷售方開具2009年1月1日后發(fā)票的方式進行抵扣。這種方式具有很大的隱蔽性，如果僅憑發(fā)票開具時間來確定是否允許抵扣，而不對該項機器設備購進、安裝和使用情況進行專門的調(diào)查核實，很難發(fā)現(xiàn)問題。
（二）企業(yè)可能將增值稅轉型政策實施前購進的固定資產(chǎn)虛假退貨
一般納稅人可能將2009年1月1日以前購入且已索取發(fā)票的機器設備，通過虛構退貨業(yè)務，讓銷售方開具紅字發(fā)票沖減銷售后，再重新開具發(fā)票的方式進行抵扣（此情況基層稅務機關遇到較多）。而小規(guī)模納稅人則可能將2009年1月1日以前銷售的貨物，通過虛構退貨業(yè)務，開具紅字發(fā)票后再重新開具發(fā)票，按新的征收率3%計算稅款而達到少繳增值稅的目的。
（三）企業(yè)可能將非抵扣范圍的固定資產(chǎn)進行抵扣
按照增值稅轉型政策規(guī)定，一般納稅人購進的符合規(guī)定范圍的機器、機械、交通工具等固定資產(chǎn)，可以從當期進項稅額中抵扣。而房屋、建筑物，以及應征消費稅的汽車、摩托車、游艇等是不允許抵扣的。但納稅人可能將購入的應征消費稅的汽車、摩托車、游艇等，通過變換開票產(chǎn)品名稱的方式進行抵扣，或者在建造房屋、基礎設施等非抵扣范圍的固定資產(chǎn)時，將購入的鋼材、水泥等建筑用材料，通過向銷售方索取增值稅專用發(fā)票的方式進行抵扣。
（四）一般納稅人認定標準降低帶來管理難題
修訂后的《實施細則》將工業(yè)和非工業(yè)的一般納稅人年應稅銷售額標準分別由100萬元和180萬元降低至50萬元和80萬元，達到標準的增值稅小規(guī)模納稅人（以下簡稱“小規(guī)模納稅人”）必須申請或者被強制認定為一般納稅人。一般納稅人認定標準“門檻”降低后，一般納稅人數(shù)量將驟然增多，大批財務核算水平相對較低、納稅意識較差的小規(guī)模納稅人將進入一般納稅人的行列。同時，很多毛利率較高、難以取得進項發(fā)票、經(jīng)營百貨日用品等購買方不需要增值稅專用發(fā)票貨物的小規(guī)模納稅人是極不愿意申請或者被強制認定為一般納稅人的。今后稅務機關管理的難度大大增加了。
（五）新修訂的《增值稅條例》依然沒有解決農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票抵扣問題
多年來，國家出于調(diào)動和保護農(nóng)民積極性，解決農(nóng)產(chǎn)品銷售的難題，方便納稅人收購農(nóng)產(chǎn)品時發(fā)票開具，允許從事農(nóng)產(chǎn)品收購的納稅人自行開具農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票并可以抵扣稅款，但其弊端是有目共睹的。例如：收購的品種、數(shù)量、金額等完全由納稅人自行掌握，稅務機關對其收購情況難以核實，管理難度和執(zhí)法風險很大。不法分子利用虛開的農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票虛抵稅款進而使虛開增值稅專用發(fā)票的大案要案不斷發(fā)生，給國家稅收造成了巨大損失。基層稅務機關要求取消農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票和改變現(xiàn)行抵扣政策的呼聲很高，但新修訂的《增值稅條例》和《實施細則》卻依然保留了納稅人憑農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票抵扣稅款的規(guī)定，沒有從根本上解決農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票帶來的弊端。
（六）按簡易辦法征收適用征收率繁雜且法律依據(jù)不足
按照原《增值稅條例》規(guī)定，小規(guī)模納稅人適用6%的征收率，一般納稅人部分貨物比照小規(guī)模納稅人執(zhí)行6%的征收率。后因商業(yè)小規(guī)模納稅人改按4%征收率執(zhí)行，至此次轉型實施前，對一般納稅人部分貨物分別按照6%或4%的征收率執(zhí)行。而按照新修訂的《增值稅條例》規(guī)定，小規(guī)模納稅人的征收率不再區(qū)分工業(yè)和商業(yè)，一律按照3%的征收率執(zhí)行。但目前對一般納稅人部分貨物依然延續(xù)原政策適用6%、4%征收率，甚至有許多適用4%征收率再減半征收的規(guī)定，不僅名目繁多，計算復雜，而且沒有了執(zhí)行的法律依據(jù)。
二、加強增值稅管理的建議
（一）加強對票流、款流、物流的人工審核，做好固定資產(chǎn)抵扣管理
對于納稅人申報抵扣2009年1月1日以后購入固定資產(chǎn)取得的增值稅專用發(fā)票，實行“單獨申報、人工審核”等措施，對票流、款流、物流實施嚴格審核，確定其業(yè)務和發(fā)票開具時限是否為2009年1月1日以后實際發(fā)生。一是票據(jù)流審核，審核其票面貨物所填列名稱，是否屬于抵扣范圍內(nèi)的固定資產(chǎn)，是否屬于納稅人用于生產(chǎn)經(jīng)營的固定資產(chǎn)，審核開具發(fā)票時間與納稅人購貨驗收入庫時間是否一致等；二是資金流審核，審核資金來源和支付的真實性，是否按規(guī)定支付貨款，如是否支付給了增值稅專用發(fā)票所列的銷售企業(yè)，防止從第三方取得發(fā)票：三是實物流審核，深入企業(yè)實地查看實物，驗明生產(chǎn)廠家及具體用途，并與購貨合同等逐項進行核對，防止虛假購進和騙抵稅款。除此之外，還要加強固定資產(chǎn)投入使用情況的后續(xù)跟蹤監(jiān)控。
（二）加強紅字發(fā)票監(jiān)控，嚴格審核退貨真實性
對機器設備銷售企業(yè)和小規(guī)模納稅人在2009年1月1日前后開具的紅字發(fā)票或者開具紅字發(fā)票的申請，要嚴格進行審查，逐份查明原因，審查其是否屬于真實退貨，有無實際收到所退貨物，是否將貨款全部退給購貨方，防止納稅人虛假沖銷以前年度銷售，重新開具增值稅專用發(fā)票給購貨方抵扣稅款，或者重新開具普通發(fā)票，以低征收率3%計算而少繳應繳增值稅。對不符合紅字發(fā)票開具規(guī)定的，嚴格按照發(fā)票管理辦法進行處罰。
（三）規(guī)范一般納稅人資格認定手續(xù)，加強日常控管
雖然一般納稅人認定的銷售額標準降低了，但對一般納稅人財務核算的要求和其他管理要求不能降低，稅務機關應準確把握增值稅管理的一般性要求，依法加強對一般納稅人的認定管理，嚴把一般納稅人認定關口，特別是要嚴格執(zhí)行小規(guī)模納稅人銷售額超標強制認定一般納稅人的規(guī)定。
（四）取消農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票，廢止自開自抵稅款制度
針對當前農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票和納稅人自開自抵稅款帶來的種種弊端，以及這種發(fā)票管理和抵扣制度對稅務機關帶來的執(zhí)法風險，應盡快取消農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票，廢止納稅人自行開具農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票、自行抵扣稅款的規(guī)定。同時，應對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)單位和農(nóng)民個人實行戶籍地管理制度，可以設計一種農(nóng)產(chǎn)品專用銷售發(fā)票。收購農(nóng)產(chǎn)品的納稅人可以憑農(nóng)產(chǎn)品專用銷售發(fā)票抵扣稅款。
（五）依法統(tǒng)一簡易辦法征收率，簡化征收管理
現(xiàn)行《增值稅條例》規(guī)定，增值稅除了基本法定稅率外，只有3%的征收率，除此之外的征收率，都是沒有法律依據(jù)的。因此，應將目前一般納稅人部分貨物按照簡易辦法征稅的征收率6%、4%、3%等統(tǒng)一確定為3%。這樣不僅使一般納稅人部分貨物按簡易辦法征稅適用的征收率有了法律依據(jù)，而且可以簡化稅企雙方的計算和征納。況且從目前的三種征收率適用的部分貨物和征收率之間的差異看，統(tǒng)一按3%征收對稅收的影響甚微（特別是按4%征收率計算，或者按4%征收率減半即2%征收的項目更是如此）。