增值稅審計一般應遵循增值稅的計稅規(guī)律以確定審查環(huán)節(jié)，重點審查征稅范圍、銷售額與銷項稅額、進項稅額的結轉與進項稅額轉出、應納稅額與出口貨物退(免)稅。下面僅對增值稅中的銷售額與銷項稅額、進項稅額抵扣時限與進項稅額結轉、轉出的審計重點加以闡述。
一、銷售額審查
根據(jù)現(xiàn)行增值稅法的有關規(guī)定，銷項稅額的計算要素有二：銷售額與適用稅率。銷售額的審查是增值稅審查的首要環(huán)節(jié)，應重點審查以下幾方面內容：
(一)銷售貨物或應稅勞務收取價外費用是否并入應稅銷售額?按規(guī)定只要是跟銷售有關的收費如：賣方提供裝卸所得收入等都應并入應稅銷售額。企業(yè)在銷售貨物或收取購貨方的價外收入時存在不開發(fā)票，或將已收取的價外收入通過往來賬款處理，或直接抵賬，沖銷各自的往來賬，或長期掛在往來賬上，到一定時間就以清理“呆滯賬”的方式，將其列入往來賬的貨物銷售收入或價外收入，直接轉入當期損益。
(二)將自產(chǎn)、委托加工或購買的貨物對外投資、分配給投資者、無償贈送他人，是否按規(guī)定視同銷售將其金額并入應稅銷售額?自產(chǎn)、委托加工的貨物只有分配給股東時才可按成本轉銷售收入。
(三)銷售殘次品(廢品)、半殘品、副產(chǎn)品和下腳料等取得的收入是否并入銷售額?審計時發(fā)現(xiàn)多數(shù)企業(yè)把此項收入計入小金庫，或直接沖減成本或費用。
(四)將自產(chǎn)或委托加工的貨物用于非應稅項目以及集體福利、個人消費的，是否視同銷售將其金額并入應稅銷售額?一些企業(yè)沒有并入應稅銷售額，直接計入福利費用或企業(yè)管理費。
(五)采取以舊換新方式銷售貨物，是否按新貨物的同期銷售價格確認應稅銷售額?如：企業(yè)促銷零售價1107元，收回舊物作價100元實收1070元，企業(yè)按實收價計收入就會少計銷項稅。
(六)以物易物或應稅貨物低償債物，是否并入應稅銷售額?實際上企業(yè)很少有并入應稅銷售額，多數(shù)直接轉往來賬或不入賬。
(七)移送貨物用于銷售是否按規(guī)定視同銷售將金額并入應稅銷售額?設有兩個以上機構實行統(tǒng)一核算的納稅人，將貨物從一個機構移送其他機構用于銷售，視同銷售貨物，但相關機構在同一縣(市)的除外。
(八)采取還本銷售方式銷售貨物，是否從應稅銷售額中減除了還本支出，造成少計應稅銷售額?這種銷售方式是納稅人為了加速資金周轉而采取的一種促銷手段。其還本支出可作為產(chǎn)品銷售費用處理。
(九)混合銷售行為和兼營的非應稅勞務，按規(guī)定應當征收增值稅的，其應稅銷售額的確認是否正確?；旌箱N售行為如征增值稅，應以納稅申報表為依據(jù)，結合“主營業(yè)務收入”明細賬，查明申報的銷售額是否正確。
(十)納稅人發(fā)生銷售退回或銷售折讓，是否依據(jù)退回的增值稅專用發(fā)票或購貨主管稅務機關開具的“企業(yè)進貨退回及索取折讓證明單”，按退貨或折讓金額沖減原銷售額?
(十一)銷售自己使用過的固定資產(chǎn)，屬于應征消費稅的機動車、摩托車、游艇，售價超過原值的，按照4%的征收率減半征收增值稅，售價未超過原值的免征增值稅。
(十二)為銷售貨物而出租、出借包裝物收取押金，因逾期而不再退還的，是否已并入應稅銷售額并按所包裝貨物適用稅率計算納稅?同時應注意審查有關特殊的納稅規(guī)定，如對銷售酒類產(chǎn)品(除適用啤酒、黃酒外)收取的包裝物押金的規(guī)定。
(十三)采取折扣方式銷售貨物，將折扣額另開發(fā)票的，是否從應稅銷售額中減除了折扣額，造成少計應稅銷售額?
二、進項稅額抵扣時限與進項稅額結轉、轉出的審查
(一)進項稅額抵扣時限的審查要點。
1.自2003年3月1日起，增值稅一般納稅人申請抵扣的防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，必須自該專用發(fā)票開具之日起90日內到稅務機關認證，否則不予抵扣進項稅額。
2.對納入防偽稅控管理的企業(yè)，取得防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，屬于扣稅范圍的，應于納稅申報前到稅務機關申報認證，在取得稅務機關開具的《認證結果通知書》和加蓋“認證相符”戳記的專用發(fā)票抵扣聯(lián)后，申報抵扣稅款，凡認證不符的，不得作為扣稅憑證。
3.增值稅一般納稅人認證通過的防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，應當在認證通過的當月按照增值稅有關規(guī)定核算當期進項稅額并申報抵扣，否則不予抵扣進項稅額。
(二)進項稅額結轉的審查要點。
審查納稅人是否存在多計進項稅額的問題，不僅要從計算進項稅額的憑證上進行審查，而且還要審查有無擴大結轉、計提進項稅額范圍的問題。
1.免征增值稅項目的購進貨物和應稅勞務，是否結轉進項稅。
2.購進固定資產(chǎn)是否結轉了進項稅額。
3.非增值稅勞務項目購進貨物和勞務，是否結轉了進項稅額。
4.用于集體福利或個人消費的購進貨物或勞務，是否結轉了進項稅額。
5.在建工程項目所用的購進貨物和應稅勞務是否結轉了進項稅額。
6.購進貨物發(fā)生的非正常損失，是否結轉了進項稅額。
1～5購買時就知道與生產(chǎn)產(chǎn)品無關，不應抵扣進項稅，應價稅一并計入購買貨物成本中。
一、銷售額審查
根據(jù)現(xiàn)行增值稅法的有關規(guī)定，銷項稅額的計算要素有二：銷售額與適用稅率。銷售額的審查是增值稅審查的首要環(huán)節(jié)，應重點審查以下幾方面內容：
(一)銷售貨物或應稅勞務收取價外費用是否并入應稅銷售額?按規(guī)定只要是跟銷售有關的收費如：賣方提供裝卸所得收入等都應并入應稅銷售額。企業(yè)在銷售貨物或收取購貨方的價外收入時存在不開發(fā)票，或將已收取的價外收入通過往來賬款處理，或直接抵賬，沖銷各自的往來賬，或長期掛在往來賬上，到一定時間就以清理“呆滯賬”的方式，將其列入往來賬的貨物銷售收入或價外收入，直接轉入當期損益。
(二)將自產(chǎn)、委托加工或購買的貨物對外投資、分配給投資者、無償贈送他人，是否按規(guī)定視同銷售將其金額并入應稅銷售額?自產(chǎn)、委托加工的貨物只有分配給股東時才可按成本轉銷售收入。
(三)銷售殘次品(廢品)、半殘品、副產(chǎn)品和下腳料等取得的收入是否并入銷售額?審計時發(fā)現(xiàn)多數(shù)企業(yè)把此項收入計入小金庫，或直接沖減成本或費用。
(四)將自產(chǎn)或委托加工的貨物用于非應稅項目以及集體福利、個人消費的，是否視同銷售將其金額并入應稅銷售額?一些企業(yè)沒有并入應稅銷售額，直接計入福利費用或企業(yè)管理費。
(五)采取以舊換新方式銷售貨物，是否按新貨物的同期銷售價格確認應稅銷售額?如：企業(yè)促銷零售價1107元，收回舊物作價100元實收1070元，企業(yè)按實收價計收入就會少計銷項稅。
(六)以物易物或應稅貨物低償債物，是否并入應稅銷售額?實際上企業(yè)很少有并入應稅銷售額，多數(shù)直接轉往來賬或不入賬。
(七)移送貨物用于銷售是否按規(guī)定視同銷售將金額并入應稅銷售額?設有兩個以上機構實行統(tǒng)一核算的納稅人，將貨物從一個機構移送其他機構用于銷售，視同銷售貨物，但相關機構在同一縣(市)的除外。
(八)采取還本銷售方式銷售貨物，是否從應稅銷售額中減除了還本支出，造成少計應稅銷售額?這種銷售方式是納稅人為了加速資金周轉而采取的一種促銷手段。其還本支出可作為產(chǎn)品銷售費用處理。
(九)混合銷售行為和兼營的非應稅勞務，按規(guī)定應當征收增值稅的，其應稅銷售額的確認是否正確?；旌箱N售行為如征增值稅，應以納稅申報表為依據(jù)，結合“主營業(yè)務收入”明細賬，查明申報的銷售額是否正確。
(十)納稅人發(fā)生銷售退回或銷售折讓，是否依據(jù)退回的增值稅專用發(fā)票或購貨主管稅務機關開具的“企業(yè)進貨退回及索取折讓證明單”，按退貨或折讓金額沖減原銷售額?
(十一)銷售自己使用過的固定資產(chǎn)，屬于應征消費稅的機動車、摩托車、游艇，售價超過原值的，按照4%的征收率減半征收增值稅，售價未超過原值的免征增值稅。
(十二)為銷售貨物而出租、出借包裝物收取押金，因逾期而不再退還的，是否已并入應稅銷售額并按所包裝貨物適用稅率計算納稅?同時應注意審查有關特殊的納稅規(guī)定，如對銷售酒類產(chǎn)品(除適用啤酒、黃酒外)收取的包裝物押金的規(guī)定。
(十三)采取折扣方式銷售貨物，將折扣額另開發(fā)票的，是否從應稅銷售額中減除了折扣額，造成少計應稅銷售額?
二、進項稅額抵扣時限與進項稅額結轉、轉出的審查
(一)進項稅額抵扣時限的審查要點。
1.自2003年3月1日起，增值稅一般納稅人申請抵扣的防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，必須自該專用發(fā)票開具之日起90日內到稅務機關認證，否則不予抵扣進項稅額。
2.對納入防偽稅控管理的企業(yè)，取得防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，屬于扣稅范圍的，應于納稅申報前到稅務機關申報認證，在取得稅務機關開具的《認證結果通知書》和加蓋“認證相符”戳記的專用發(fā)票抵扣聯(lián)后，申報抵扣稅款，凡認證不符的，不得作為扣稅憑證。
3.增值稅一般納稅人認證通過的防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，應當在認證通過的當月按照增值稅有關規(guī)定核算當期進項稅額并申報抵扣，否則不予抵扣進項稅額。
(二)進項稅額結轉的審查要點。
審查納稅人是否存在多計進項稅額的問題，不僅要從計算進項稅額的憑證上進行審查，而且還要審查有無擴大結轉、計提進項稅額范圍的問題。
1.免征增值稅項目的購進貨物和應稅勞務，是否結轉進項稅。
2.購進固定資產(chǎn)是否結轉了進項稅額。
3.非增值稅勞務項目購進貨物和勞務，是否結轉了進項稅額。
4.用于集體福利或個人消費的購進貨物或勞務，是否結轉了進項稅額。
5.在建工程項目所用的購進貨物和應稅勞務是否結轉了進項稅額。
6.購進貨物發(fā)生的非正常損失，是否結轉了進項稅額。
1～5購買時就知道與生產(chǎn)產(chǎn)品無關，不應抵扣進項稅，應價稅一并計入購買貨物成本中。